El esquema adjunto representa una proteína asociada a una molécula de ADN. El recuadro 1 es una ampliación de una zona de la proteína y el recuadro 2 es una ampliación de la molécula de ADN.

1. Indique cuál es la unidad fundamental de las proteínas, qué enlace establecen explicando los grupos químicos implicados e identifique los átomos señalados con las letras A, B, C y D. [1 punto]
2. Indique los nombres de los dos tipos principales de conformaciones de la estructura secundaria de una proteína, señalando los tipos de enlace que mantienen estable dicha estructura y los grupos químicos entre los que se establecen estos enlaces. [1 punto]
3. Señale a qué nivel estructural de la proteína que se representa afectaría un cambio que produjera la separación de las dos cadenas peptídicas y explique qué efecto tendría. [0,5 puntos]
La unidad fundamental de las proteínas es el
: una molécula con un carbono
al que se unen un grupo amino, un grupo carboxilo, un hidrógeno y un radical variable R, que es lo que distingue a unos aminoácidos de otros. En el recuadro 1 los radicales aparecen precisamente como R1, R2, R3 y R4.
El enlace que los une es el
. Se forma por reacción de condensación entre el grupo
(
) de un aminoácido y el grupo
(
) del siguiente, con pérdida de una molécula de agua. Lo que queda es una unión
, es decir, un enlace amida, con carácter parcial de doble enlace: por eso los seis átomos del grupo peptídico son coplanarios y no puede girar en torno a él, lo que condiciona todo el plegamiento posterior.
Comparando el dibujo con esa estructura, los átomos señalados son:
| | |
|---|
| A | Gris | Carbono |
| B | Rojo | Oxígeno |
| C | Amarillo | Nitrógeno |
| D | Verde | Hidrógeno |
Se reconocen sin ambigüedad: el rojo aparece siempre unido por doble enlace a un carbono, formando el carbonilo; el amarillo es el que enlaza un carbono con el siguiente y lleva un hidrógeno, es decir, el nitrógeno del grupo amino; y el verde, el más pequeño y siempre terminal, es el hidrógeno.
Los dos tipos principales son la
-
y la
o conformación
plegada. En la primera la cadena se enrolla en espiral dextrógira, con 3,6 aminoácidos por vuelta y los radicales hacia fuera; en la segunda la cadena se dispone en zigzag y varios tramos se colocan uno junto a otro, en paralelo o en antiparalelo, formando una superficie plegada en abanico.
Las dos se mantienen estables por
, que son uniones débiles pero muy numerosas.
Esos puentes se establecen entre los grupos del esqueleto peptídico, no entre los radicales: concretamente entre el
(
) de un enlace peptídico y el
(
) de otro. La diferencia está en cuáles: en la
-hélice se forman dentro de la misma cadena, entre un aminoácido y el situado cuatro posiciones más adelante, y quedan paralelos al eje de la hélice; en la lámina
se forman entre tramos distintos, perpendiculares a las cadenas.
La proteína del esquema está formada por
distintas, dibujadas en dos colores, de modo que separarlas afectaría a la
, que es precisamente el nivel que describe cómo se asocian entre sí varias subunidades ya plegadas.
El efecto sería la
. Cada subunidad conservaría su estructura primaria, secundaria y terciaria, pero el sitio funcional de una proteína con estructura cuaternaria se forma en la interfaz entre subunidades, y al separarlas desaparece. En este caso concreto, la proteína es un factor que reconoce el ADN, y son las dos cadenas juntas las que crean la superficie capaz de encajar en la doble hélice; sueltas, la afinidad por el ADN se pierde y la proteína deja de regular al gen. Es lo mismo que le ocurre a la hemoglobina cuando se disocian sus cuatro cadenas: cada una sigue fijando oxígeno, pero se pierde la cooperatividad, que es lo que la hace útil.