Ejercicio resuelto de Proteínas · Biología · Andalucía · 2021

La tripsina es una enzima proteolítica que cataliza la hidrólisis de los enlaces peptídicos en los que el grupo carboxilo es aportado por la Lys o Arg. El péptido con el que se trabaja es el siguiente:

$\text{H}_{2}\text{N-Lys} - \text{Met} - \text{Cys} - \text{Met} - \text{Lys} - \text{Ala} - \text{Cys} - \text{Arg} - \text{Ala-COOH}$

a) Escriba la secuencia de los fragmentos resultantes de la acción de la tripsina en ese péptido. [0,5 puntos]

b) La quimotripsina tiene la misma función, pero corta por el extremo carboxilo del aminoácido Met. En este caso, ¿cuáles son los fragmentos resultantes? [0,5 puntos]

$\textbf{a) Escriba la secuencia de los fragmentos resultantes de la acción de la tripsina en ese péptido. [0,5 puntos]}$

La tripsina hidroliza los enlaces peptídicos en los que el grupo carboxilo lo aporta la lisina o la arginina, es decir, corta inmediatamente después de cada Lys y de cada Arg.

En el péptido, numerando desde el extremo N-terminal, la lisina ocupa las posiciones $1$ y $5$ y la arginina la posición $8$, de modo que los cortes se producen tras esos tres aminoácidos. Resultan cuatro fragmentos:

$\text{Lys}$

$\text{Met}-\text{Cys}-\text{Met}-\text{Lys}$

$\text{Ala}-\text{Cys}-\text{Arg}$

$\text{Ala}$

Obsérvese que cada fragmento termina precisamente en la Lys o la Arg que ha marcado el corte, salvo el último, que corresponde al extremo C-terminal del péptido original.

$\textbf{b) La quimotripsina tiene la misma función, pero corta por el extremo carboxilo del aminoácido Met. En este caso, ¿cuáles son los fragmentos resultantes? [0,5 puntos]}$

Ahora los cortes se producen tras cada metionina, que en este péptido ocupa las posiciones $2$ y $4$. Resultan tres fragmentos:

$\text{Lys}-\text{Met}$

$\text{Cys}-\text{Met}$

$\text{Lys}-\text{Ala}-\text{Cys}-\text{Arg}-\text{Ala}$

El ejercicio ilustra el fundamento de la determinación de la estructura primaria de una proteína: al digerir la misma cadena con enzimas de especificidad distinta se obtienen conjuntos de fragmentos diferentes, y el solapamiento entre ellos permite reconstruir la secuencia completa.